水稻种子的浸种一般在常温条件下，需要5—7天，累计积温80—100℃,浸种缸最好放在屋里，浸种水一定要清洁，不要把锅或容器里的油带进种子里，浸种和消毒应结合在一起，杀死恶苗病病菌及其他种子所带的病菌，现在普遍用的药剂有10％的咪鲜胺乳油、使百克、施保克效果都比较好，浸种时先把药放进缸里搅拌均匀，再把种子散放缸内，不要整袋装缸，以防止药的成分不能均匀地附着种子表面，达不到杀菌的效果，如果品种多，怕混杂的话，种子要装进网袋里，网袋最好要宽松，水要完全淹没种子，以达到浸种消毒效果。
吸足水分的种子，谷壳半透明，腹白分明可见，胚部膨大突起，胚乳变软，手捻成粉，种子折断无响声。浸种时间应充分，不是浸种时间越长越好，浸种时间过长会使种子内部可溶物外渗，使种子养分流失，甚至种子在水中发芽。
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